Étude de l'apport de la métagénomique dans le diagnostic des infections sexuellement transmissibles

À propos

Vous consultez de façon spontanée dans le service de maladies infectieuses et tropicales de l’hôpital Saint-Antoine pour une PrEP VIH (Prophylaxie pré-exposition au VIH). Dans le cadre de votre suivi, le médecin va prescrire des dépistages de certaines infections sexuellement transmissibles (IST) (hépatite B, hépatite C,syphilis, gonocoque, chlamydia, infection VIH), afin de vous proposer le traitement adéquat en cas d’infection.
L’objectif principal de l’étude est d’évaluer la performance du diagnostic par NGS des IST (Chlamydiatrachomatis (CT), Neisseria gonorrhoeae (NG)) par rapport aux techniques de référence.
Les objectifs secondaires sont d’évaluer la performance du diagnostic par NGS des IST associées (syphilis, trichomonose…), de décrire l’histoire naturelle de la colonisation à Mycoplasma genitalium (bactérie non recherchée si vous êtes asymptomatique, d’évaluer la prévalence d’agents non recherchés habituellement dans le dépistage des IST (HSV, Haemophilus ducreyi, Campylobacter sp, Shigella sp…) et d’estimer la prévalence des différentes IST.
L’étude sera proposée à tous les hommes adultes ayant des relations sexuelles avec d’autres hommes (HSH)et venant en consultations PrEP au sein du service de maladies infectieuses et tropicales de l’hôpital Saint-Antoine.
Après recueil de votre consentement, vous serez alors inclus dans l’étude pour une durée de 12 mois avec des visites de suivi tous les 3 mois, correspondant à une prise en charge classique pour un patient PrEPeur.
Lors de chaque visite (J0=jour d’inclusion, M3, M6, M9 et M12), il vous sera demandé de :
- Répondre à un questionnaire sur vos antécédents de prise d’antibiotiques, d’IST, votre consommation de tabac, drogues, d’alcool et vos pratiques sexuelles,
- Réaliser les prélèvements supplémentaires suivants:
 Un écouvillon rectal,
 Un écouvillon pharyngé,
 Un prélèvement urinaire.
Ces prélèvements seront réalisés selon les procédures habituelles du service. Le diagnostic des IST (Chlamydia
et Gonocoque) sera effectué selon 2 techniques :
- La technique de référence,
- La technique NGS.
Les résultats de la technique NGS ne seront pas prises en compte pour votre suivi médical et seront exploités uniquement dans le cadre de l’étude. Seuls les résultats des dépistages des IST effectués selon la technique de référence vous seront délivrés et utilisés pour votre prise en charge lors de votre visite suivante.
Afin d’atteindre les objectifs de l’étude, il est prévu d’inclure 207 patients. La durée de votre participation à l’étude est de 12 mois environ. La durée totale de l’étude est d’environ 19 mois. Elle comprend le temps d’inclure l’ensemble des participants et leur suivi de 12 mois.